在真核细胞中，RNA聚合酶II（Pol II）所介导的转录并非总是严格地起始于启动子。在特定情况下，非启动子区域也会发生有限的隐秘转录（Cryptic transcription）。这类转录现象在衰老、癌变的细胞中更为常见。然而，领域内对驱动隐秘转录的分子机制，以及这些隐秘转录本所具有的生物学功能认知仍非常有限。围绕以上问题，中国海洋大学海洋生物多样性与进化教育部重点实验室田苗与法国蒙彼利埃大学、CNRS人类遗传学研究所 Kazufumi Mochizuki研究组开展了合作研究，在PNAS期刊发表了题为“Mediator-associated proteins and the small RNA–guided Polycomb repressive complex enhance cryptic transcription for transposon exclusion” 的研究论文。该研究发现，纤毛虫原生动物四膜虫会在有性生殖过程中启动程序性隐秘转录，还证实了这一转录所产生的非编码RNA对于四膜虫精确删除转座子（Transposable element，TE）、完成有性生殖具有至关

2026年7月，《中国科学：生命科学》（Science China Life Sciences）正式出版“纤毛虫研究”专刊，系统展示了该领域在多样性、转录调控、染色质结构及生活史调控等方面的最新进展，并入选期刊封面。专刊由进化所宋微波院士担任客座编辑，原生动物学团队的高凤、田苗，中科院水生所的缪炜、熊杰，中国科学技术大学的宋晓元、山西大学的王伟等学者共同参与和组织。纤毛虫是原生生物中多样性最高、演化最成功的类群之一。作为单细胞真核生物，它们不仅拥有独特的双核系统（生殖系小核与体细胞大核），还贡献了端粒与端粒酶、核酶等多项诺贝尔奖级别的生物学发现。近年来，纤毛虫在环境监测、农业病害防控及土壤生态修复中的应用潜力也日益受到重视。本期专刊共收录5篇代表性研究，涵盖五大前沿方向：一、绘制十亿年演化图谱。进化所原生动物学团队与美国Laura Katz教授团队合作构建了迄今最全面的纤毛虫系统发育基因组学数据集，涵盖190个物种、49个目、16个纲，基本实现纲级全覆盖。基于此，研究重构了纤毛虫的演化历史，解决了长期存在的分类学争议，提出了最新的纤毛门分类系统，并将其起源时间定位于约10.5亿年

近日，北京大学生命科学学院张蔚教授应邀来访重点实验室，在达尔文馆学术厅作了题为《Evolution and diversification of mimicry and masquerade in butterflies》的学术报告。报告由赵呈天教授主持。 本次报告聚焦蝶类拟态与伪装的演化多样性机制，系统分享课题组前沿研究成果，学校师生到场聆听学习并开展交流研讨。 蝶类有超过18700种，其蝶翅结构相对简单但展示了复杂的花纹和功能，是研究物种形成和适应性演化的经典体系，可从遗传和物种等多个层面理解生物多样性的形成机制。一些蝶类的翅花纹具有拟态现象，即蝶类通过模仿其他物种而获得优势，是一种直观的受到自然选择压力驱动的适应性演化实例。代表性的拟态研究体系包括无毒物种模仿有毒物种的贝氏拟态，以玉带凤蝶物种组为例；有毒物种间互相模仿的穆式拟态，以袖蝶属为例。相对于经典的拟态研究体系，枯叶蛱蝶属展示的叶形拟态是一种特殊的伪装形式，被华莱士认为是“蝴蝶产生的最精妙无疑的保护形态的范例”。上述研究整合了宏观演化和微观演化的研究思路、以及计算和实验相结合的研究方法，探索了蝴蝶叶形伪装拟态

生物被膜是细菌在宿主体内与自然环境中形成的结构化胞外基质包裹的细胞集合体。即便菌群遗传背景完全一致，生物被膜内部的细胞也会随营养、代谢等微环境梯度发生显著的功能分化，这种细胞亚群分工，是细菌群体抵御外界逆境、维持感染持续性的核心策略。尽管生物被膜的细胞异质性已经得到广泛报道，但传统测序手段会掩盖单细胞层面的转录与代谢特征，不同亚群的功能分工、亚群间的协同互作如何支撑生物被膜整体抗逆能力，仍有待深入解析。近日，中国海洋大学海洋生物被膜团队借助细菌单细胞转录组测序技术，揭示了万古霉素处理条件下葡萄球菌生物被膜的单细胞转录动态，揭示了果糖代谢介导的亚群分化以及生物被膜内代谢互作，阐明了生物被膜依靠代谢异质性实现群体抗逆的新机制。团队首先针对模式葡萄球菌生物被膜开展单细胞转录组分析，对比万古霉素处理前后生物被膜的单细胞转录特征（图1A）。将生物被膜内细菌划分为 9个功能各异的细胞亚群（图1B）。亚群 1、亚群 2 在生物被膜内显著富集，成为维系生物被膜稳态的两大核心类群。图1 葡萄球菌生物被膜单细胞转录组测序分析进一步分析发现，两个亚群采用差异化且互为补充的适应策略。亚群1高表达果糖 PTS